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  张荣

  张荣主任医师教授

  复旦大学附属华山医院 神经外科

  胶质瘤 13票脑肿瘤 8票生殖细胞瘤 7票颅咽管瘤 3票

  擅长:儿童脑肿瘤和神经系统先天性畸形。尤其擅长髓母细胞瘤、颅咽管瘤、胶质瘤、生殖细胞肿瘤,以及狭颅症和脊髓栓系等的手术及综合治疗。

  专业方向: 神经外科

  主观疗效:100%满意态度:97%满意在线问诊: 45元起预约挂号: 已开通预约挂号: 已开通

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  李永强

  李永强主治医师

  北京协和医院 泌尿外科

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  擅长:肾癌靶向治疗,泌尿系结石,前列腺增生,晚期前列腺癌

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  金玲

  金玲主任医师

  北京儿童医院 血液肿瘤中心

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  擅长:各类型儿童淋巴瘤及淋巴结病,是北京儿童医院淋巴瘤组成员,从事儿童淋巴瘤的临床诊治和科研工作二十余年

  专业方向: 小儿血液科

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积水潭医院患者评价:

  疾病:

  神经鞘瘤

  脑肿瘤

  患者:

  匿名患者[山东 枣庄]

  医生:

  王芙昱 副主任医师

  患者主观疗效:很满意态度:很满意

  病情描述:神经鞘瘤压迫右眼视神经,右眼接近失明。

  看病过程:经过王主任细心观察和经验判断,直接判断神经鞘瘤,经多方研究,最后做微创手术。

  康复情况:手术后 视力慢慢有所好转,身体健康,非常感谢王主任的细心照顾

  

  疾病:

  皮脂腺囊肿

  皮肤肿瘤

  患者:

  匿名患者[北京 海淀]

  医生:

  王兴林 主任医师

  教授

  患者主观疗效:很满意态度:很满意

  非常非常感谢王医生,鼻翼处因为处理不当长了皮脂腺囊肿,困扰了好几年。一直找不到合适的治疗方案

  找到王医生射频治疗后,已经痊愈。自己很满意,比照手术的方式,创口几乎可以忽略不计 真的是很好的技术。也很感激王医生。把自己在意了这么多年的的“心病”祛除了,非常感恩。

  后续还需要其他的治疗还会再找王医生!

  

  疾病:

  左下肢坏死,动脉闭塞

  糖尿病足

  患者:

  匿名患者[辽宁 沈阳]

  医生:

  陈华 主任医师

  教授

  患者主观疗效:很满意态度:很满意

  病情描述:左下肢坏死,动脉闭塞

  看病过程:感谢陈主任的救治,非诚感谢团队医生尤其是王医生的关心,这次母亲进京看病,病情危机,有幸得到陈医生的救治,使母亲保住了生命。千言万语也无法表达对您的感激!感恩,此致敬礼!

  康复情况:感谢陈主任的叮嘱,正在康复中

  

  疾病:

  大隐静脉曲张

  静脉曲张

  患者:

  匿名患者[北京 朝阳]

  医生:

  刘杰 主治医师

  患者主观疗效:很满意态度:很满意

  病情描述:左腿静脉曲张20余年,去年12月出现静脉栓塞。

  看病过程:经门诊大夫确诊,建议住院手术治疗,由此刘大夫成为我的经治医生。入院三天后,进行了大隐静脉部分剥离术和结扎术

  康复情况:出院三周后行走自如,伤口结痂全部脱落,仅余少部分区域有硬化未完全消散。

  

国内权威医院介绍:

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上海交通大学医学院附属仁济医院(北院)

上海交通大学医学院附属仁济医院北院区占地10亩,建筑面积17500平方米,设有门诊、住院、手术室、遗传咨询室、医学影像室、辅助生殖实验室等科室,并按不同患者就医需求设立VIP服务和专门的病房,能开展所有不孕不育诊疗技术,为患者提供高质量的优生优育和辅助生殖医疗服务。2013年7月,以辅助生殖和优生技术而闻名的仁济医院生殖医学专科正式落户仁济医院北院(浦东新区灵山路845号)。仁济医院是上海市最早开展辅助生殖技术临床及科研工作的医疗单位。1987年率先在上海地区开展人工授精技术服务;2004年成为上海市唯一一家被卫生部批准,可同时进行第一代、第二代试管婴儿和供精人工受精等辅助生殖技术的医疗机构;2009年牵头成立上海交通大学不孕不育专病诊治中心;2010年获准建设上海市生殖与优生优育技术中心;2012年成为上海市辅助生殖与优生重点实验室。目前,我国不孕不育占育龄夫妇的10%-15%。仁济医院生殖医学科不孕不育年门诊量超过12万人次,已实施“试管婴儿”和“人工授精”近两万例,帮助一万余对夫妇获得健康宝宝,辅助生殖技术达国内领先水平。北院拥有上海市的人类精子库。该精子库是上海交通大学Med-X-仁济医院临床干细胞研究中心临床基地、是上海市分子男科学重点实验室临床基地;设有人类精子库实验室、上海男性健康俱乐部、上海男科学研究所精子发育与遗传实验室等。现任精子库主任为李铮教授。截至2013年11月,精子库已成功招募上万名捐献者,通过供精人工技术和体外受精技术已使2,998个不孕家庭获得天伦之乐。同时作为精子库重要特色之一,已为近千名男性提供精子冷冻保存。仁济医院拥有一支强大的生殖医学专家队伍。现已形成以著名生殖医学专家陈子江教授为学科带头人,赵晓明、孙赟、洪燕、李铮、高玉平、高敏芝等为中坚力量的高层次专家队伍。一流的专家、一流的技术,将为广大不孕不育患者提供一流的服务,为人类的生殖健康事业做出重要贡献。


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新热点:组蛋白乙酰化相关lncRNA构建肿瘤风险模型|乙酰化|蛋白|肿瘤|细胞

导语

组蛋白乙酰化相关lncRNA(HARlncRNA)在各种癌症中起重要作用,但对肺腺癌(LUAD)的影响尚不清楚。本研究旨在开发一种新的基于HARlncRNA的LUAD预后模型,并探索其潜在的生物学机制。

背景介绍

今天小编为大家带来一篇最新的热点文章:基于组蛋白乙酰化相关lncRNA构建肿瘤预后模型,文章题目为HistoneacetylationrelatedIncRNA:Potentialbiomarkersforpredictingprognosisandimmuneresponseinlungadenocarcinoma,anddistinguishinghotandcoldtumours,影响因子8分+。

数据介绍

从TCGA中获取LUAD患者的基因表达谱、体细胞突变数据和临床数据。

研究设计

从TCGA中获取LUAD患者的基因表达谱、体细胞突变数据和临床数据。

结果解析

01组蛋白乙酰化相关lncRNA的鉴定

采用共表达分析寻找LUAD中组蛋白乙酰化修饰相关基因相关的lncRNA(图1A)。共鉴定出21个与总生存期(OS)密切相关的lncRNA(p<0.05)。作者进一步执行LASSO回归,并进行10倍交叉验证(图1B,C)。使用多变量Cox回归分析获得7个用于模型构建的lncRNA。最后通过热图对这七种最具特征性的lncRNA和组蛋白乙酰化修饰相关基因进行了相关性分析(图1D)。

图1

02构建风险评分模型

作者使用多变量Cox回归结果后,建立了风险评分公式。Riskscore=LINC01537×(1.)+MED4−AS1×(−1.)+AC009831.1×(−1.)+IER3−AS1×(0.)+AC022613.1×(0.)+AC068338.3×(−0.)+NKILA×(0.)。

基于七个lncRNA的预后风险模型显示,训练和验证队列的低风险亚组中,OS更长(图2A,E,I)。在所有LUAD患者队列中,较高的风险评分对应于更多的死亡事件(图2B,C,F,G,J,K)。LINC01537,IER3AS1,AC022613.1和NKILA高表达的LUAD患者与高风险评分相关。相比之下,AC068338.3、AC009831.1和MED4AS1在低风险评分患者中高表达(图2D,H,L)。

图2

此外,作者还分析了细胞系中LINC01537,IER3AS1,NKILA和MED4AS1的表达(图3AH)。这些结果与公共数据库的结果一致。

图3

03风险评分模型的预后能力

使用单变量和多变量Cox回归分析评估独立预后模型的预后能力。结果表明,风险评分是一个独立的预后因素(图4A,B)。AUC在1年,3年和5年时更为突出,表明构建的模型预测患者的准确性很高(图4C)。

将构建的模型与ROC曲线的其他临床特征进一步比较。在这些因素中,风险评分的AUC值最高(图4D)。作者使用PCA进一步验证了模型的预后价值(图4E,F)。风险模型可以有效地区分患者,风险评分的C指数最高。这些结果证实,基于七种HARlncRNA表达谱的风险模型是一个潜在的预后标志物。

图4

最后对分期和性别进行了分层分析。低风险患者在早期和晚期、女性和男性患者中表现出持续更好的总生存期(图4GJ)。

04预测患者预后的列线图

作者开发了一个总体生存的列线图,包括性别、淋巴结转移、肿瘤大小、年龄、分期和计算的风险评分,以估计患者的生存概率。结果显示,当评分为328时,1年、3年和5年生存率分别为0.863、0.554和0.288(图5A)。

图5B显示了LUAD在1年、3年和5年的校准曲线,表明列线图可以可靠地预测这些患者的OS。ROC曲线显示,列线图比年龄和预后风险评分模型具有更强的预测价值(图5C)。在单因素Cox回归分析中,分期、淋巴结转移、肿瘤大小和列线图是独立的预后因素(图5D)。在多变量回归分析中,列线图仍然是唯一的独立预后因素(图5E)。

图5

05功能富集

通过差异分析发现了两组之间的差异表达基因。GO富集结果表明,BP富集在微管运动、抗菌体液反应和纤毛运动过程,CC过程集中在细胞运动纤毛、顶端质膜和顶端部分,MF富集在受体配体活性和信号受体激活活性(图6AC)。

图6

06体细胞变异

通过对瀑布图的分析,发现TP53、TTN和MUC16在两组中排名前三(图7A、B)。图7C显示两组之间的TMB表达存在差异。生存分析显示高TMB患者的预后更好(图7D)。作者进一步分析了该模型和TMB的组合,结果显示低风险和高TMB的患者预后更好(图7E)。结果表明,预测模型不受TMB状态的影响,模型在预测预后方面比TMB更准确。

图7

07免疫浸润和免疫治疗

作者分析了两组之间ICI基因表达的差异,发现大多数基因在低风险组中高表达,包括CD28,LAIR1,KIR3DL1,CD48,CD80和ADORA2(图8A)。基于ESTIMATE算法,分析了两组之间免疫细胞的丰度,发现低风险组的免疫评分和估计评分较高,而基质评分没有差异(图8B,C)。

图8

作者使用CIBERSORT分析了22个浸润免疫细胞。两组表现出不同的免疫学特征。高危组M1巨噬细胞和CD8+T细胞显著升高,而静息树突状和肥大细胞低危组显著富集(图8D)。接下来,使用ssGSEA来分析免疫相关功能。II型IFN反应和HLA免疫相关功能在低风险组中比在高风险组中更活跃(图8E)。

TIDE可以预测患者是否会从ICIs的使用中受益,评分越高,患者越容易免疫逃逸。图8FH显示,低风险组的TIDEE评分较高,表明低风险组的患者更容易发生免疫逃逸。T细胞功能障碍在低风险组中更为显著。然而,在高危人群中观察到免疫排斥更频繁。

08药物敏感性

对LUAD三种常见治疗药物的敏感性分析表明,高危患者可能对紫杉醇、吉非替尼和厄洛替尼具有更高的敏感性(图9AC),这表明风险评分模型可能有助于识别更有可能从化疗和靶向治疗中受益的LUAD患者。

图9

09识别冷热肿瘤和ICI敏感性

不同的免疫微环境具有不同的亚型,导致不同的免疫治疗效果。聚类可以区分热肿瘤和冷肿瘤并指导免疫治疗。因此,使用R包“ConsensusClusterPlus”根据聚类分析将患者分为三个聚类。(图10A)。生存分析表明,cluster3的OS最长(图10B)。TSNE和PCA表明这三个cluster是可区分的(图10C,D)。

图10

作者进一步分析了免疫细胞在不同cluster的浸润情况,结果显示cluster1和3具有更高程度的CD8+T免疫细胞浸润(图11A)。cluster1和3的免疫评分高于2(图11B)。几乎所有的ICI,包括LAG3和CD274,在cluster1中最高(图11C)。

最后作者分析了不同cluster对药物的敏感性。结果显示,1和2可能对吉西他滨、紫杉醇和吉非替尼更敏感(图11D–F)。基于上述分析结果,可以改进LUAD患者免疫治疗的研究,提高患者治疗的准确性。

图11

小编总结

本研究基于与预后相关的组蛋白乙酰化lncRNA构建了风险评分模型,采用ROC曲线、单因素分析和多因素分析验证了模型的准确性。高危组患者表现出较高的免疫细胞浸润,预计对化疗、靶向治疗和免疫治疗药物更敏感。因此,基于七种预后lncRNA的风险评分模型可以正确估计LUAD患者的预后,并确定化疗、靶向治疗和免疫治疗的潜在候选者。

进一步的聚类分析可以区分热肿瘤和冷肿瘤并指导免疫治疗。因此,将患者分为三组。cluster1和3表现出更高的CD8+T免疫细胞浸润。cluster1和3的免疫评分更高。因此,cluster1和3可以被认为是热肿瘤。此外,1和3作为热肿瘤可能对免疫疗法更敏感。这表明聚类不仅可以预测患者的预后,还可以指导个体化治疗。


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