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- 宣武医院
- 2024-04-12 16:09:51
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王恩敏
王恩敏主任医师教授
复旦大学附属华山医院 神经外科
脑膜瘤 14票脑肿瘤 13票脑血管畸形 11票颅底肿瘤 3票
擅长:伽马刀、射波刀治疗小于3CM的听神经瘤,三叉神经鞘瘤,中小型颅底脑膜瘤,海绵窦脑膜瘤、手术后残留脑膜瘤,小的垂体瘤、术后残留垂体瘤,小型脑血管畸形(AVM),脑转移瘤,脊索瘤、松果体区肿瘤、血管母细胞瘤、颈静脉孔区肿瘤、一部分小的低级别胶质瘤、脑外科手术后残留的各种脑肿瘤、以及恶性胶质瘤手术、放化疗后复发病人的射波刀。 射波刀治疗肺癌、肺部转移瘤、小的肝癌、肝脏转移瘤、胰腺癌、腹膜后淋巴结转移、前列腺癌、骨转移瘤,特别是脊柱(椎体)转移瘤,椎间孔或椎旁神经纤维瘤和脊髓AVM(脊髓动静脉畸形)。
专业方向: 神经外科
主观疗效:100%满意态度:100%满意在线问诊: 45元起预约挂号: 已开通
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丁伟
丁伟副主任医师
上海第九人民医院 整复外科
去眼袋 246票双眼皮手术 41票微整形除皱 29票整形 26票
擅长:面部年轻化微整形抗衰老综合治疗、全面颈部提升,眼周年轻化、面部软组织不对称、眼部美容整形(眼袋、眼睑皮肤松弛、双眼皮、开眼角)、垫下巴(隆颏)、面瘫。
专业方向: 整形科
主观疗效:100%满意态度:100%满意在线问诊: 150元起预约挂号: 已开通
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刘海元
刘海元主任医师教授
北京协和医院 妇科
子宫肌瘤 749票子宫内膜异位症 250票卵巢囊肿 197票宫颈癌前病变 120票
擅长:宫颈病变。子宫肌瘤。卵巢肿瘤。子宫内膜异位症。宫腔占位,子宫内膜增生及不典型增生。女性不育症。妇科良恶性肿瘤的微创治疗,妇科单孔腹腔镜手术。手术期快速康复。
专业方向: 妇科
主观疗效:99%满意态度:99%满意在线问诊: 299元起预约挂号: 已开通
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李宁
李宁副主任医师
北京儿童医院 泌尿外科
小儿肾积水 13票尿道下裂 8票鞘膜积液 7票隐睾 5票
擅长:尿道下裂、肾积水,隐睾、包茎、包皮粘连、鞘膜积液、隐匿阴茎、小阴唇粘连、睾丸肿瘤、肾输尿管积水、重肾、肾发育不良、精索静脉曲张等疾病。
专业方向: 小儿泌尿科
主观疗效:100%满意态度:100%满意在线问诊: 60元起预约挂号: 已开通
宣武医院患者评价:
疾病:
冠心病
冠心病
患者:
匿名患者[北京 西城]
医生:
汪奇 副主任医师
副教授
患者主观疗效:很满意态度:很满意
康复情况:感谢汪主任,我今天出院了,辛苦您了,特别感谢
疾病:
腰椎管狭窄.腰间盘突出.腰椎滑脱
腰椎间盘突出
患者:
匿名患者[北京 朝阳]
医生:
尚爱加 主任医师
教授
患者主观疗效:很满意态度:很满意
病情描述:腰直不起来,活动才能走路
看病过程:从网上找的尚主任,主任看完需要手术
康复情况:术后恢复很好,谢谢尚主任。
疾病:
帕金森
帕金森
患者:
匿名患者[江苏 扬州]
医生:
崔志强 主任医师
副教授
患者主观疗效:很满意态度:很满意
病情描述:帕金森病史7年,最近对正常生活有影响,特别是夹杂着其它一些状况,比如感冒、拉稀、咳嗽等,自理能力下降明显。于是计划进行脑起搏器手术。
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康复情况:目前手术伤口正在恢复中,下一步,根据医治计划,等患者彻底恢复后,进行开机,愿一切都好。
疾病:
冠心病
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患者:
匿名患者[山东 淄博]
医生:
汪奇 副主任医师
副教授
患者主观疗效:很满意态度:很满意
康复情况:间断性的心绞痛大概两三年时间,通过自己亲戚来找的汪奇主任,做了造影主任说不需要放支架,挺感激主任,特别感谢
国内权威医院介绍:
上海中医药大学附属曙光医院西院 上海中医药大学附属曙光医院是一所沪上的百年老院,三级甲等综合性中医院、位列上海十大综合性医院之一、全国示范中医院。1984—2010年十四次蝉联“上海市文明单位”称号;1999年荣获卫生部“全国百佳医院”称号;2004年第三次获得“全国卫生系统先进集体”荣誉;2005年被评为全国精神文明建设工作先进单位;多次获得全国医院文化建设先进单位称号;2009年获得了国务院颁发的“上海市迎世博优质服务贡献奖”。2001年成为全国首家通过ISO9001质量管理体系认证的中医医院。2010年,上海市人民政府和卫生部将曙光医院列为省部共建研究型中医院。医院拥有东西二部,核定床位1200张,开放床位1320张。西部位于卢湾区普安路185号,毗邻淮海公园,占地28亩。东部位于浦东张江高科技园区张衡路528号,投资6亿元,占地160亩,是融现代建筑与传统特色为一体的园林式医院。成立于2001年的曙光医院集团目前已有10余个成员单位。2008年被批准成为“国家中医药管理局国际交流合作基地”。医院中医特色显著,优势突出,医院现拥有国家教育部“十一·五”重点学科3个:中医骨伤科学、中医内科学、中药学(中药制剂、中药临床药理)。国家临床重点专科2个:肝病科、骨伤科。国家“十二·五”重点专科11个:肾病科、内分泌科、脾胃病科、心血管科、针灸科、肛肠科、肺病科、妇科、重症医学科、护理学、临床药学。中医急诊科是国家中医药管理局急诊基地,制剂室是全国中药制剂和剂改基地。医院开设的70余个专病专科各具特色,独树一帜,享誉全国。近年来,医院坚持加强中医内涵建设,相继成立了“名医诊疗中心”、“传统诊疗中心”、“治未病中心”、“石氏伤科”、“柏氏肛肠科”、“蔡氏书屋”等科室。医院为切实做好名老中医药专家学术思想传承工作,建立了5个全国名老中医药专家传承工作室,12个上海市名中医工作室。医院拥有多个重症监护室,医疗设施先进,内外科室齐全,已具备了较强的综合救治能力,成为上海市公共卫生防治体系六个重点单位之一、浦东地区三个急救中心之一。国家中医药管理局全国中医院质量监测中心和上海市中医医疗质量控制中心也设在院内。2010年医院成为上海世博会定点医院之一,承担了世博会C片区医疗站点的医疗保障任务。医院现有职工总数1800余人,具有正高级职称102名,博士生导师41名。享受国务院特殊津贴的专家11名,入选国家级人才培养项目人员33名,担任全国和上海市专业医学会副主任委员以上的专家100余名。现拥有国家级、省级名中医15名、27名曙光名中医、26名曙光高级中医师,在充分发挥传统医学优势方面,形成了“名中医挂帅、高级中医师当家”的曙光特色。医院以建设研究型医院为目标,现有研究所4个、临床研究室14个,中医药科研三级实验室5个、二级和一级实验室8个。成立了国家级重点实验室――肝肾病证省部共建实验室。具备国际标准的I期药物临床试验病房,完成了中国首例接受世界卫生组织委托的临床实验项目。自1995年以来,承担部级、国家级课题300余项,其中包括国家863课题1项,国家重大专项6项,“十一·五”支撑项目6项、973子计划2项,国家自然基金项目60项,成为国内承担重大任务最多的中医医院。医院获得的科技成果奖160多项,其中部级、国家级科技进步奖74项,发明专利授权26项。作为全国中医院校中最先成立的临床医学院之一、世界卫生组织传统医学合作中心的临床基地,曙光临床医学院现有教研室17个,博士研究生培养点7个,硕士研究生培养点10个,博士后流动站3个。每年承担800人次以上的各类学生的临床带教工作。医院以“大医德泽生命曙光”为核心理念,在全国首创“伦理查房”,开通全国首条免费中医健康热线,锻造具有鲜明特色的曙光文化。近年来,在科学发展观的指导下,实施可持续发展战略,为实现“建设亚洲中医临床医、教、研中心”的战略目标奠定了稳固的基础。
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新热点:组蛋白乙酰化相关lncRNA构建肿瘤风险模型|乙酰化|蛋白|肿瘤|细胞
导语
组蛋白乙酰化相关lncRNA(HARlncRNA)在各种癌症中起重要作用,但对肺腺癌(LUAD)的影响尚不清楚。本研究旨在开发一种新的基于HARlncRNA的LUAD预后模型,并探索其潜在的生物学机制。
背景介绍
今天小编为大家带来一篇最新的热点文章:基于组蛋白乙酰化相关lncRNA构建肿瘤预后模型,文章题目为HistoneacetylationrelatedIncRNA:Potentialbiomarkersforpredictingprognosisandimmuneresponseinlungadenocarcinoma,anddistinguishinghotandcoldtumours,影响因子8分+。
数据介绍
从TCGA中获取LUAD患者的基因表达谱、体细胞突变数据和临床数据。
研究设计
从TCGA中获取LUAD患者的基因表达谱、体细胞突变数据和临床数据。
结果解析
01组蛋白乙酰化相关lncRNA的鉴定
采用共表达分析寻找LUAD中组蛋白乙酰化修饰相关基因相关的lncRNA(图1A)。共鉴定出21个与总生存期(OS)密切相关的lncRNA(p<0.05)。作者进一步执行LASSO回归,并进行10倍交叉验证(图1B,C)。使用多变量Cox回归分析获得7个用于模型构建的lncRNA。最后通过热图对这七种最具特征性的lncRNA和组蛋白乙酰化修饰相关基因进行了相关性分析(图1D)。
图1
02构建风险评分模型
作者使用多变量Cox回归结果后,建立了风险评分公式。Riskscore=LINC01537×(1.)+MED4−AS1×(−1.)+AC009831.1×(−1.)+IER3−AS1×(0.)+AC022613.1×(0.)+AC068338.3×(−0.)+NKILA×(0.)。
基于七个lncRNA的预后风险模型显示,训练和验证队列的低风险亚组中,OS更长(图2A,E,I)。在所有LUAD患者队列中,较高的风险评分对应于更多的死亡事件(图2B,C,F,G,J,K)。LINC01537,IER3AS1,AC022613.1和NKILA高表达的LUAD患者与高风险评分相关。相比之下,AC068338.3、AC009831.1和MED4AS1在低风险评分患者中高表达(图2D,H,L)。
图2
此外,作者还分析了细胞系中LINC01537,IER3AS1,NKILA和MED4AS1的表达(图3AH)。这些结果与公共数据库的结果一致。
图3
03风险评分模型的预后能力
使用单变量和多变量Cox回归分析评估独立预后模型的预后能力。结果表明,风险评分是一个独立的预后因素(图4A,B)。AUC在1年,3年和5年时更为突出,表明构建的模型预测患者的准确性很高(图4C)。
将构建的模型与ROC曲线的其他临床特征进一步比较。在这些因素中,风险评分的AUC值最高(图4D)。作者使用PCA进一步验证了模型的预后价值(图4E,F)。风险模型可以有效地区分患者,风险评分的C指数最高。这些结果证实,基于七种HARlncRNA表达谱的风险模型是一个潜在的预后标志物。
图4
最后对分期和性别进行了分层分析。低风险患者在早期和晚期、女性和男性患者中表现出持续更好的总生存期(图4GJ)。
04预测患者预后的列线图
作者开发了一个总体生存的列线图,包括性别、淋巴结转移、肿瘤大小、年龄、分期和计算的风险评分,以估计患者的生存概率。结果显示,当评分为328时,1年、3年和5年生存率分别为0.863、0.554和0.288(图5A)。
图5B显示了LUAD在1年、3年和5年的校准曲线,表明列线图可以可靠地预测这些患者的OS。ROC曲线显示,列线图比年龄和预后风险评分模型具有更强的预测价值(图5C)。在单因素Cox回归分析中,分期、淋巴结转移、肿瘤大小和列线图是独立的预后因素(图5D)。在多变量回归分析中,列线图仍然是唯一的独立预后因素(图5E)。
图5
05功能富集
通过差异分析发现了两组之间的差异表达基因。GO富集结果表明,BP富集在微管运动、抗菌体液反应和纤毛运动过程,CC过程集中在细胞运动纤毛、顶端质膜和顶端部分,MF富集在受体配体活性和信号受体激活活性(图6AC)。
图6
06体细胞变异
通过对瀑布图的分析,发现TP53、TTN和MUC16在两组中排名前三(图7A、B)。图7C显示两组之间的TMB表达存在差异。生存分析显示高TMB患者的预后更好(图7D)。作者进一步分析了该模型和TMB的组合,结果显示低风险和高TMB的患者预后更好(图7E)。结果表明,预测模型不受TMB状态的影响,模型在预测预后方面比TMB更准确。
图7
07免疫浸润和免疫治疗
作者分析了两组之间ICI基因表达的差异,发现大多数基因在低风险组中高表达,包括CD28,LAIR1,KIR3DL1,CD48,CD80和ADORA2(图8A)。基于ESTIMATE算法,分析了两组之间免疫细胞的丰度,发现低风险组的免疫评分和估计评分较高,而基质评分没有差异(图8B,C)。
图8
作者使用CIBERSORT分析了22个浸润免疫细胞。两组表现出不同的免疫学特征。高危组M1巨噬细胞和CD8+T细胞显著升高,而静息树突状和肥大细胞低危组显著富集(图8D)。接下来,使用ssGSEA来分析免疫相关功能。II型IFN反应和HLA免疫相关功能在低风险组中比在高风险组中更活跃(图8E)。
TIDE可以预测患者是否会从ICIs的使用中受益,评分越高,患者越容易免疫逃逸。图8FH显示,低风险组的TIDEE评分较高,表明低风险组的患者更容易发生免疫逃逸。T细胞功能障碍在低风险组中更为显著。然而,在高危人群中观察到免疫排斥更频繁。
08药物敏感性
对LUAD三种常见治疗药物的敏感性分析表明,高危患者可能对紫杉醇、吉非替尼和厄洛替尼具有更高的敏感性(图9AC),这表明风险评分模型可能有助于识别更有可能从化疗和靶向治疗中受益的LUAD患者。
图9
09识别冷热肿瘤和ICI敏感性
不同的免疫微环境具有不同的亚型,导致不同的免疫治疗效果。聚类可以区分热肿瘤和冷肿瘤并指导免疫治疗。因此,使用R包“ConsensusClusterPlus”根据聚类分析将患者分为三个聚类。(图10A)。生存分析表明,cluster3的OS最长(图10B)。TSNE和PCA表明这三个cluster是可区分的(图10C,D)。
图10
作者进一步分析了免疫细胞在不同cluster的浸润情况,结果显示cluster1和3具有更高程度的CD8+T免疫细胞浸润(图11A)。cluster1和3的免疫评分高于2(图11B)。几乎所有的ICI,包括LAG3和CD274,在cluster1中最高(图11C)。
最后作者分析了不同cluster对药物的敏感性。结果显示,1和2可能对吉西他滨、紫杉醇和吉非替尼更敏感(图11D–F)。基于上述分析结果,可以改进LUAD患者免疫治疗的研究,提高患者治疗的准确性。
图11
小编总结
本研究基于与预后相关的组蛋白乙酰化lncRNA构建了风险评分模型,采用ROC曲线、单因素分析和多因素分析验证了模型的准确性。高危组患者表现出较高的免疫细胞浸润,预计对化疗、靶向治疗和免疫治疗药物更敏感。因此,基于七种预后lncRNA的风险评分模型可以正确估计LUAD患者的预后,并确定化疗、靶向治疗和免疫治疗的潜在候选者。
进一步的聚类分析可以区分热肿瘤和冷肿瘤并指导免疫治疗。因此,将患者分为三组。cluster1和3表现出更高的CD8+T免疫细胞浸润。cluster1和3的免疫评分更高。因此,cluster1和3可以被认为是热肿瘤。此外,1和3作为热肿瘤可能对免疫疗法更敏感。这表明聚类不仅可以预测患者的预后,还可以指导个体化治疗。
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